У россиянина впервые обнаружили сразу два штамма коронавируса. Это третий подобный случай в мире
Пациент заразился двумя штаммами одновременно, но оказало ли это влияние на тяжесть болезни и смерть, пока неизвестно
До сих пор медикам удавалось выявить одновременно два штамма коронавируса только дважды: в первый раз — иракским учёным, во второй раз – швейцарским. Правда, в обоих случаях недостаток данных для исследований не позволял однозначно заключить, являлись ли эти штаммы независимыми или это был один штамм, который размножался и накапливал разные варианты мутаций.
Теперь группе исследователей из Центрального НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора удалось более внимательно проследить за взаимодействием разных штаммов коронавируса. Они описали, по-видимому, третий в мире случай заражения сразу двумя разновидностями SARS-CoV-2: пациент возрастом старше 90 лет попал в больницу с высокой температурой, где у него взяли мазок из носоглотки, а через неделю – ещё раз.
К сожалению, через несколько дней пациент скончался, но исследователи сохранили оба образца. В каждом из них при помощи секвенирования было обнаружено одновременно два штамма SARS-CoV-2. Соотношение между ними было разным: в первом мазке оно составило 69% к 31%, во втором — 3% к 97%. Получается, что за неделю второй штамм практически полностью вытеснил первый.
Чтобы убедиться в отсутствии ошибки, учёные повторно выделили РНК из образцов и снова обнаружили два штамма SARS-CoV-2. Подсчитав частоту встречаемости мутаций в геномах, исследователи заключили, что эти мутации возникли одновременно, а значит, что об эволюции штаммов речи не идёт.
Второй штамм встречается в мире довольно часто — его обнаруживали более тысячи раз в разных странах, из них 78 раз — в России. Для первого штамма совпадений в базе не нашлось. Авторы работы смогли вычислить только 571 ближайшего родственника этого штамма, три из которых встречались в России. При этом оба штамма со слизистой пациента близкими родственниками не были и относились к разным кладам на филогенетическом дереве SARS-CoV-2.
На основании полученных данных учёные резюмировали, что пациент заразился двумя штаммами коронавируса независимо друг от друга. При этом второй оказался успешнее первого, причём в масштабах страны: первый в РФ почти не встречается, а близкие родственники второго с характерными мутациями составляют 85% случаев заражения. Учёные также предположили, что двойная инфекция теоретически могла повлиять на состояние больного и ускорить его смерть.