РЕКЛАМА – ПРОДОЛЖЕНИЕ НИЖЕ

Создатели Pfizer объединились с программистами и создали нейросеть, предсказывающую опасные штаммы коронавируса

BioNTech, немецкая биотехнологическая компания, которая впервые применила технологию информационной РНК для вакцины Pfizer против COVID-19, объединилась с лондонской компанией InstaDeep для создания «эффективной системы раннего предупреждения» для выявления потенциально опасных новых вариантов коронавируса.
Создатели Pfizer объединились с программистами и создали нейросеть, предсказывающую опасные штаммы коронавируса

В ходе испытаний обе компании заявили, что их система раннего предупреждения смогла выявить 12 из 13 вариантов коронавируса, которые ВОЗ до сих пор определяла как потенциально опасные, причем с опрежением в несколько месяцев

РЕКЛАМА – ПРОДОЛЖЕНИЕ НИЖЕ

Что касается варианта Omicron, система идентифицировала его как потенциально опасный в тот же день, когда его генетическая последовательность была впервые доступна, согласно статье BioNTech и InstaDeep, опубликованной в среду в не рецензируемом академическом репозитории bioRxiv.org.

«Раннее выявление потенциальных вариантов с высоким риском может быть эффективным инструментом для предупреждения исследователей, разработчиков вакцин, органов здравоохранения и политиков, тем самым предоставляя больше времени для реагирования на новые варианты, вызывающие озабоченность», — заявил Угур Сахин, соучредитель и главный исполнительный директор BioNTech.

РЕКЛАМА – ПРОДОЛЖЕНИЕ НИЖЕ

Глобальный характер пандемии, легкая трансмиссивность вируса COVID-19 (SARS-CoV-2) и широкое использование геномного секвенирования завалили ученых данными. А поскольку вирус постоянно мутирует, постоянно обнаруживаются новые варианты, хотя подавляющее большинство этих новых вариантов не представляют повышенного риска и не создают проблем для существующих вакцин и методов лечения.

РЕКЛАМА – ПРОДОЛЖЕНИЕ НИЖЕ
РЕКЛАМА – ПРОДОЛЖЕНИЕ НИЖЕ

«Каждую неделю в настоящее время обнаруживается более 10 000 новых последовательностей вариантов, и люди-эксперты просто не могут справиться со сложными данными в таком масштабе», — заявил Карим Бегир, соучредитель и исполнительный директор InstaDeep.

Двойная система

Система, разработанная BioNTech и InstaDeep, работает двумя способами, и оба основаны на последовательности ДНК конкретного варианта вируса.

Первая часть системы предсказывает структуру шиповидного белка варианта на основе последовательности ДНК. Спайковый белок — это часть вируса, используемая для заражения клеток, а также часть, за которую прикрепляются антитела, чтобы вывести вирус из строя. Компания DeepMind написала алгоритм AlphaFold, доступной исследователям бесплатно – он помогает анализировать потоки данных.

РЕКЛАМА – ПРОДОЛЖЕНИЕ НИЖЕ

Вторая часть системы берет последовательность ДНК и обращается с ней так, как если бы это был своего рода язык. Затем он использует ИИ-методы, которые были разработаны для обработки естественного языка, чтобы изучить, насколько последовательность ДНК для шиповидного белка конкретного варианта похожа на другие известные шиповидные белки коронавируса.

Почему это важно

В результате система выводит несколько ключевых характеристик, которым в дальнейшем присваивает общий рейтинг. Чем он выше – тем более пристальное внимание ученые обращают на ту или иную разновидность коронавируса. Оперативность играет в данном случае ключевую роль, ведь чем раньше исследователи начнут работу над новыми типами вакцин, тем выше вероятность того, что очередная вспышка заболевания не станет массовой.

Загрузка статьи...