Новая программа для Sony PlayStation 3 поможет владельцам этих популярных игровых приставок не только развлекаться, но и помогать науке, участвуя в глобальной системе распределенных расчетов Foldіng@Home.

Предназначенные для развлечений приставки теперь послужат на благо науке наравне с обычными ПК и суперкомпьютерами. Как рассчитывают авторы, этот технологический прорыв поможет как минимум 10-кратно ускорить моделирование формирования трехмерной структуры белков — одного из самых сложных в вычислительном отношении процессов.

Самым мощным суперкомпьютером до недавнего времени был IBM BlueGene/L, перешагнувший рубеж в 200 терафлоп (200 триллионов операций в секунду). Суперкомпьютер MDGrape-3 с потенциальной производительностью в 1 петафлоп (тысячу терафлоп), также предназначенный для расчетов молекулярной динамики, установлен летом 2006 г. в Иокогаме. Однако системы распределенных вычислений, объединяющие силы тысячи их более слабых собратьев, успешно справляются с расчетами, доступными этим монстрам.

Folding@Home — проект Стэнфордского университета, задача которого — с помощью распределенных вычислений изучать фолдинг белков и болезни, связанных с нарушением этого процесса. И похоже, что теперь основными поставщиками вычислительных ресурсов для него станут игровые приставки, которые отодвинут персональные компьютеры на второй план.

Новая технология Sony позволяет привлечь к распределенным вычислениям целую армию геймеров,. Она использует мощный игровой процессор Cell и не менее производительный графический процессор, в сумме обеспечивающих для каждой приставки производительность в 100 гигафлоп (миллиард операций в секунду). Производительность вычислений сети из 10 0000 таких приставок будет измеряться уже в петафлопах. Благодаря этому перед учеными открываются перспективы решения прежде недоступных задач, значительно приближая перспективы разработки способов излечения некоторых форм рака, болезней Альцгеймера и Хантингтона, и т. д.

Ожидается, что новая расчетная программа для PS3 будет поддерживать расширенные средства визуализации молекулярной динамики белка в режиме реального времени, а интерактивный контроллер приставки позволит рассмотреть молекулу белка с разных сторон в трехмерном режиме с детализацией до каждого атома.

«Коммерческая биотехнология»